溫州商會成立于1901年，訖今已有一百多年的歷史。1949年12月，溫州市工商業聯合會籌備委員會成立，1955年1月溫州市工商聯正式成立。1990年9月，溫州市委、市政府批準市工商聯增掛“溫州市總商會”牌子；1992年3月，溫州市委在溫州市工商聯建立了黨組；2002年9月，溫州市工商聯（總商會）第九次會員代表大會首次選舉非公有制經濟代表人士擔任會長。

溫州市工商聯現有副主席27名，總商會副會長28名，常委145名，執委279名。目前，全市工商聯系統會員總數約5.1萬；市工商聯所屬商會496家，其中市屬171家（包括行業協會商會128家，在溫異地商會43家），縣屬325家（包括行業協會商會120家，鄉鎮街道商會145家，其他60家）。